ČVUT DSpace
  • Prohledat DSpace
  • English
  • Přihlásit se
  • English
  • English
Zobrazit záznam 
  •   ČVUT DSpace
  • České vysoké učení technické v Praze
  • Fakulta biomedicínského inženýrství
  • katedra lékařských a humanitních oborů (ukončeno 01.02.2014)
  • Bakalářské práce - 17111
  • Zobrazit záznam
  • České vysoké učení technické v Praze
  • Fakulta biomedicínského inženýrství
  • katedra lékařských a humanitních oborů (ukončeno 01.02.2014)
  • Bakalářské práce - 17111
  • Zobrazit záznam
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

CrAssphage v odpadních vodách a lidské stolici

The occurrence of CrAssphage in sewage waters and in human faeces

Typ dokumentu
bakalářská práce
bachelor thesis
Autor
Mazánková Karla
Vedoucí práce
Cinek Ondřej
Oponent práce
Efremova Yulia
Studijní obor
Zdravotní laborant
Studijní program
Specializace ve zdravotnictví
Instituce přidělující hodnost
katedra zdravotnických oborů a ochrany obyvatelstva



Práva
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Metadata
Zobrazit celý záznam
Abstrakt
Hlavním cílem této práce je provedení detekce a fylogenetické analýzy poměrně nedávno objeveného bakteriofága CrAssphage ze vzorků stolic dětí pocházejících z evropských, asijských a afrických zemí. Přítomnost crassfágu v prostředí byla testována na vzorcích odpadních vod. Jelikož práce s těmito vzorky podléhá biologickému riziku BSL2, je v teoretické části toto riziko shrnuto a jsou navržena pravidla pro práci s využitím dostupných zdrojů a stávající legislativy. Díky technikám sekvenování nové generace byl identifikován crassfág ve stolicích pocházejících od dětí z Nigérie, Ázerbájdžánu, Jordánska a Súdánu. Takto pozitivní vzorky byly spolu s dalšími stolicemi z Norska a Finska a českými odpadními vodami podrobeny amplifikaci tří informativních úseků crassfága, Sangerovu sekvenování a konstrukci fylogenetických stromů. Tak byla v rámci mezinárodní studie zhodnocena příbuznost genotypů tohoto fága. Přínosem provedené práce jsou nové znalosti o genetické diverzitě tohoto zcela nejprevalentnějšího viru v lidském střevě. I díky našim prioritním datům z Afriky lze potvrdit jeho celosvětový výskyt. Virus se přitom vyznačuje značnou diverzitou, která je bezesporu odrazem evolučních tlaků během jeho soužití s dosud neznámým bakteriálním hostitelem v lidském střevě.
 
The main aim of the work was to detect and genotype the recently discovered bacteriophage CrAssphage in stool samples of children from European, Asian and African countries. The presence of CrAssphage in the environment was tested in a set of Czech sewage water samples. As the work with these samples poses a biological risk, in the theoretical part of the work the biological safety measures are designed and discussed according to present laws. By using next generation virome sequencing, we identified CrAssphage in stool samples of children from Nigeria, Azerbaijan, Jordan and Sudan. Such positive samples were then analyzed along with stools from Norway and Finland, and with sewage waters from Czechia. Three informative regions of CrAssphage genome were amplified, sequenced and subjected to phylogenetic analysis in order to evaluate relatedness of its strains in the context of a world-wide study. The merit of the present work is in new knowledge obtained on the genetic diversity of this most prevalent virus in the human gut. It was possible to confirm its world-wide distribution (also to our priority data from Africa) and to show its marked diversity which undoubtedly mirrors various evolutionary pressures during its symbiosis with a yet unknown bacterial host in the human intestine.
 
URI
http://hdl.handle.net/10467/69086
Zobrazit/otevřít
PLNY_TEXT (1.973Mb)
POSUDEK (142Kb)
POSUDEK (143.7Kb)
Kolekce
  • Bakalářské práce - 17111 [1957]

České vysoké učení technické v Praze copyright © 2016 

DSpace software copyright © 2002-2016  Duraspace

Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
@mire NV
 

 

Užitečné odkazy

ČVUT v PrazeÚstřední knihovna ČVUTO digitální knihovně ČVUTInformační zdrojePodpora studiaPodpora publikování

Procházet

Vše v DSpaceKomunity a kolekceDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slovaTato kolekceDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slova

Můj účet

Přihlásit se

České vysoké učení technické v Praze copyright © 2016 

DSpace software copyright © 2002-2016  Duraspace

Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
@mire NV