Software pro vizualizaci, segmentaci a sonifikaci ultrazvukových vokalizací laboratorních potkanů

Antonín Gazda

Software for Visualization, Segmentation and Sonification of Ultrasonic Vocalizations of Laboratory Rats

Type of document

diplomová práce
master thesis

Author

Antonín Gazda

Supervisor

Čmejla Roman

Opponent

Kudláček Jan

Field of study

Audiovizuální technika a zpracování signálů

Study program

Elektronika a komunikace

Institutions assigning rank

katedra radioelektroniky

Rights

A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html

Metadata

Show full item record

Abstract

Tato práce představuje Squeak Peek Studio, uživatelsky přívětivou MATLAB aplikaci pro analýzu ultrazvukových vokalizací (USV) laboratorních potkanů. Software je navržen pro intuitivní použití a integraci do stávajících výzkumných pracovních postupů. Kombinuje segmentaci, vizualizaci, sonifikaci a vyhodnocení v jednotném rozhraní. Implementuje několik detekčních algoritmů - včetně prahovacích a bayesovských metod - s laditelnými parametry a možností interaktivní úpravy. Modul sonifikace založený na fázovém vokodéru a synchronizace videa umožňuje hlubší interpretaci chování. Cílem nástroje je zefektivnit analýzu USV a podpořit jak automatizované tak i manuální zpracování.

This thesis presents Squeak Peek Studio, a user-friendly MATLAB application for analyzing ultrasonic vocalizations (USVs) in laboratory rats. Designed for intuitive use and integration into existing research workflows, the software combines segmentation, visualization, sonification, and evaluation in a unified interface. It implements multiple detection algorithms - including threshold-based and Bayesian methods - with tunable parameters and interactive editing. A phase vocoder-based sonification module and video synchronization enable deeper behavioral interpretation. The tool aims to streamline USV analysis and support both automated processing and human-in-the-loop refinement.