Přibližná pokrytí textových řetězců

Abstract

Tato práce staví na publikaci Kędzierského and Radoszewského, kteří představili vylepšené polynomiální algoritmy řešící problém k-přibližných pokrytí řetězců nad Hammingovou, Levenshteinovou a váženou editační vzdáleností. Práce tyto algoritmy důkladně popisuje, vysvětluje a poskytuje jiný úhel pohledu. Algoritmy jsou implementovány a problémy, které řesí jsou zasazeny do kontextu dalších pravidelností v řetězcích. Implementce je experimentálně otestována a jsou popsány hlavní implementační kroky.

This thesis builds upon recent findings of Kędzierski and Radoszewski who presented improved polynomial time algorithms for computing k-approximate covers of strings under Hamming, Levenshtein and weighted edit distance. These algorithms are thoroughly described providing explanations from different point of view. The algorithms are implemented and the problems they solve are inset into the context of other string regularities. The implementation is experimentally evaluated alongside with the description of the main implementation decisions.