Molekulárně genetické metody studia vlivu infekce Leishmania major na mikrobiom trávicího traktu myší
Estimation of influence of Leishmania major infection on mouse gut microbiome by tools of molecular genetics
Typ dokumentu
diplomová prácemaster thesis
Autor
Zavoloková Barbora
Vedoucí práce
Jarošíková Taťána
Oponent práce
Javůrková Veronika
Studijní obor
Přístroje a metody pro biomedicínuStudijní program
Biomedicínská a klinická technikaInstituce přidělující hodnost
katedra přírodovědných oborůObhájeno
2018-06-19Práva
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.htmlVysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Metadata
Zobrazit celý záznamAbstrakt
Leishmanióza je jednou z nejvíce opomíjených nemocí. Je způsobena parazitickým prvokem rodu Leishmania. Toto onemocnění je problém v 98 zemích po celém světě. Každý rok toto onemocnění způsobí asi 50000 úmrtí. Je známo, že střevní mikrobiota mají vliv na imunitní systém a případná mikrobiální dysbióza způsobená onemocněním nebo infekcí parazity může mít negativní vliv na zdraví hostitele. Představujeme metody molekulární biologie pro zkoumání vlivu L. major na střevní mikrobiom. Naším cílem bylo identifikovat změny osídlení tlustého a tenkého střeva způsobené infekcí parazitem L. major. Všechny parametry byly analyzovány 8 týdnů po infekci L. major. Zaměřili jsme se na analýzu mikrobiomu pomocí metody PCR-DGGE, vybrané zóny gelu byly následně identifikovány pomocí Sangerova sekvenování pro vytvoření dendrogramu a shlukové analýzy. Mikroby byly dále analyzovány sekvenováním nové generace (Ion Torrent PGM). Data byla analyzována softwarem QIIME. Leishmaniasis is one of the most neglected diseases. It is caused by protozoan parasite of genus Leishmania. The disease is a health problem in 98 countries worldwide. It caused about 50000 deaths each year. Intestinal microbiota plays a key role in development of immune system. The microbiota dysbiosis caused by disease or parasite infection can have negative effect on host's health. We present use methods of molecular biology for examination of influence of L. major infection in gut. We aim to identify colonization changes in colon and small intestine after L. major infection. All these parameters were analysed 8 weeks after infection of L. major. We focused on the PCR-DGGE method, selected bands were identified by Sanger sequencing which lead to dendrogram creation and cluster analysis. Microbes were further analysed by sequencing of the new generation (Ion Torrent PGM). Data was analysed by QIIME software.
Kolekce
- Diplomové práce - 17101 [236]