ČVUT DSpace
  • Prohledat DSpace
  • English
  • Přihlásit se
  • English
  • English
Zobrazit záznam 
  •   ČVUT DSpace
  • České vysoké učení technické v Praze
  • Fakulta jaderná a fyzikálně inženýrská
  • katedra matematiky
  • Bakalářské práce - 14101
  • Zobrazit záznam
  • České vysoké učení technické v Praze
  • Fakulta jaderná a fyzikálně inženýrská
  • katedra matematiky
  • Bakalářské práce - 14101
  • Zobrazit záznam
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Stochastické modely chemické kinetiky

Stochastic modelling of chemical kinetics

Typ dokumentu
bakalářská práce
bachelor thesis
Autor
Čajánek Ondřej
Vedoucí práce
Vejchodský Tomáš
Oponent práce
Klika Václav
Studijní obor
Matematické inženýrství
Studijní program
Aplikace přírodních věd
Instituce přidělující hodnost
katedra matematiky
Obhájeno
2017-02-14



Práva
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Metadata
Zobrazit celý záznam
Abstrakt
Obsahem této práce je studie tří základních stochastických modelů chemické kinetiky. Konkrétn ě se věnujeme porovnání Gillespieho stochastického simulačního algoritmu a základní chemické rovnici s jejich aproximací ve formě chemické Langevinovy rovnice. Zaměřujeme se na stochastický popis reakčních sítí s malými populacemi některých reagujících chemikálií. Zde na základě výpočtu stacionárního rozdělení pro genetické regulační sítě s a bez zpětné vazby ukazujeme, že chemická kinetika takovýchto systémůje ovlivněna jejich velikostí. Zejména studujeme výskyt většího počtu stabilních stavů, které jsou generované náhodným šumem. Ukazujeme, že toto dobře popisuje Gillespieho algoritmus a základní chemická rovnice, zatímco chemická Langevinova rovnice není schopna větší počet stabilních stavů zachytit.
 
Three fundamental stochastic models are presented and studied in this thesis. More specifically, we compare Gillespie?s stochastic simulation algorithm and the equivalent chemical master equation with an approximation in the form of the chemical Langevin equation. We focus on a stochastic description of reaction networks with small populations of certain chemical species. Based on the computed stationary distribution of a gene regulatory network with and without feedback we show that the chemical kinetics of such a system is highly influenced by its size. The noise-induced multimodality can be captured by Gillespie?s algorithm and the chemical master equation. In contrast to that the chemical Langevin equation fails to predict this type of multimodality.
 
URI
http://hdl.handle.net/10467/68209
Kolekce
  • Bakalářské práce - 14101 [312]

České vysoké učení technické v Praze copyright © 2016 

DSpace software copyright © 2002-2016  Duraspace

Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
@mire NV
 

 

Užitečné odkazy

ČVUT v PrazeÚstřední knihovna ČVUTO digitální knihovně ČVUTInformační zdrojePodpora studiaPodpora publikování

Procházet

Vše v DSpaceKomunity a kolekceDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slovaTato kolekceDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slova

Můj účet

Přihlásit se

České vysoké učení technické v Praze copyright © 2016 

DSpace software copyright © 2002-2016  Duraspace

Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
@mire NV