• Hledání sekvenčních motivů v mRNA selektovaných vazbou na translační iniciační faktory z rodiny eIF4E 

      Autor: Jan Holčák; Vedoucí práce: Pospíšek Martin; Oponent práce: Kléma Jiří
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2020-09-01)
      Výběr vhodného nástroje hledajícího neobjevené motivy v RNA sekvencích je obtížný. Náročná instalace programů může vést k problémům s nasazením. Dostupné sady nástrojů nejsou připraveny na hromadné výpočty. Nástroje schopné ...
    • Nástroj pro objevování sekvenčních motivů v RNA-Seq datech 

      Autor: Petr Schimperk; Vedoucí práce: Pospíšek Martin; Oponent práce: Kléma Jiří
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2024-06-18)
      Hledání a analýza sekvenčních motivů jsou důležitým krokem při zkoumání funkcí genů a regulace genové exprese. Pro řešení této úlohy v současnosti existuje více než 150 heuristických i neheuristických algoritmů využívajících ...