Interaktivní ontologický dashboard
Interactive Ontology Dashboard
Typ dokumentu
bakalářská prácebachelor thesis
Autor
Avetis Mkrtchian
Vedoucí práce
Křemen Petr
Oponent práce
Overton James Alexander
Studijní program
Softwarové inženýrství a technologieInstituce přidělující hodnost
katedra počítačůPráva
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.htmlVysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Metadata
Zobrazit celý záznamAbstrakt
OBO Foundry přispívá ke standardizaci biomedicínských terminologií, taxonomií a ontologií. Pro sledování kvality ontologií vytváří statistiky a reporty. Pro pochopení problémů napříč ontologiemi, problémů jednotlivých ontologických konceptů nebo jiných složitějších dotazů však nástroje chybí. Cílem této práce je vytvořit řešení pro dashboardy nad katalogy ontologií a otestovat je na dashboardu OBO Foundry. Jako významný testovací případ se zaměřujeme na biomedicínské terminologie, taxonomie a ontologie spravované v OBO Foundry. To zahrnuje návrh sdílené strojově-čitelné reprezentace metrik kvality ontologií a omezení kvality. Pro testování řešení bude tedy třeba v rámci práce standardizovat proprietární metriky kvality ontologií a reporty o validaci ontologií dodávané jedním z nástrojů OBO Foundry - ROBOT. OBO Foundry contributes to standardizing biomedical terminologies, taxonomies and ontologies. To monitor ontology quality they produce statistics and reports. However, understanding cross-ontology problems, problems of individual ontology concepts, or other more complex queries, the tools are missing. The goal of this work is to create a solution for dashboards over ontology catalogues and test it on the OBO Foundry dashboard. As a prominent test case, we aim at the biomedical terminologies, taxonomies, and ontologies maintained by the OBO Foundry. This involves designing a shared machine-readable representation of ontology quality metrics and quality constraints. Thus, to test the solution, proprietary ontology quality metrics and ontology validation reports delivered by one of OBO Foundry tools - ROBOT - will need to be standardized as a part of the work.
Kolekce
- Bakalářské práce - 13136 [1133]