Interaktivní aplikace pro analýzu klinických dat pacientů po transplantaci krvetvorby

Abstract

Cieľom tejto práce je vytvorenie interaktívnej webovej aplikácie. Venuje sa analýze a vizualizácii dát o pacientoch, ktorí podstupujú alogénnu transplantáciu krvotvorby. Vizualizácie a analýza sú rozdelené do 3 kategórií a každá z nich sa zaoberá rozdielnou problematikou. Práca detailnejšie popisuje, ako jednotlivé dôležité štatistické elementy, ktoré sú v aplikácii využívané, fungujú. Aplikácia poskytuje uživateľské rozhranie a serverovú logiku, ktoré sú napísané v jazyku R za pomoci frameworku Shiny. Spracovávané dáta sú zhromažďované v databázi MySQL, ktorá beží v lokálnej sieti ÚHKT. Táto aplikácia má slúžiť pre kontrolu kvality vykonávaných úkonov v ÚHKT a pre vedecké účely.

The goal of this thesis is to create an interactive web application. The application analysis and visualizes patients data. These patients undergo allogeneic hematopoiesis transplantation. Visualizations and analysis are divided into 3 different categories and each category follows up different problems. The thesis describes in detail, how individual statistical elements used in the application work. The application provides a user interface and server logic. Both of these are written in programming language R with help of its framework Shiny. Processed data are being stored in MySQL database in ÚHKT's local network. This application will serve ÚHKT staff for quality monitoring and it will be also used for scientific purposes.