Aplikace konečných smíšených modelů pro analýzu genetické informace z DNA
An Application of Finite Mixture Models for Analysis of Gene Expression from DNA Microarrays Measurement System
Typ dokumentu
bakalářská prácebachelor thesis
Autor
Pilný Vladimír
Vedoucí práce
Tkacz Ewaryst
Oponent práce
Jiřina Marcel
Studijní obor
Biomedicínská a klinická technikaStudijní program
Biomedicínská a klinická technikaInstituce přidělující hodnost
katedra biomedicínské technikyObhájeno
2006-06-27Práva
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.htmlVysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Metadata
Zobrazit celý záznamAbstrakt
Tato práce se týká analýzy dat genové exprese měřených pomocí DNAčipů. Prvníčástpředstavuje biologickýúvod do celé problematiky, počínaje přípravou genetických vzorkůaž po převod nasnímaných dat na hodnoty genové exprese. Následuje oddíl klasifikujícístatistické metody zpracování dat se zvláštním zaměřením na teorii konečných mixture modelů. Stěžejní prací pak byla implementace algoritmů na hledání parametrů právě těchto modelůaplikovaných na data z genové exprese. Výstupem je pak kromě této práce programgmmgenevytvořený ve vývojovém prostředí Matlab 7. This thesis relates to analysis of gene expression measured by DNA microarrays. First part rep- resents the biological introduction, starting with preparation of genetic samples, up to conver- sion of scanned data to gene expression values. Following section classifies statistical methods for handling the data, with special emphasis on the theory of Finite mixture models. Fundamen- tal work is implementation of algorithms for searching parameters of these models applied to gene expression data. The output beyond this thesis is a programgmmgenecreated in Matlab 7development environment.
Kolekce
- Bakalářské práce - 17110 [869]