Optimalizace parametrů zpracování difrakčních dat oxidázy z Microdochium nivale
Optimization of processing of diffaction data of oxidase from Microdochium nivale
| dc.contributor.advisor | Kolenko Petr | |
| dc.contributor.author | Malý Martin | |
| dc.date.accessioned | 2016-10-17T08:31:19Z | |
| dc.date.available | 2016-10-17T08:31:19Z | |
| dc.date.issued | 2016-08-19 | |
| dc.identifier | KOS-587864715105 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10467/66027 | |
| dc.description.abstract | Microdochium nivale je stopkovýtrusná houba napadající trávníky.Její karbohydrátová oxidáza nachází uplatnění v mnoha průmyslových odvětvích. Krystaly tohoto enzymu byly měřeny na synchrotronu Petra III. Vizuální kontrolou byl odhalen rozštěp krystalu. Data byla zpracována několika programy: XDS, Xia2 a iMOSFLM (se seškálováním pomocí Aimless). Bylo pozorováno radiační poškození krystalu. Optimální zpracování experimentu bylo provedeno pomocí XDS pri rozlišení 2,0 A a vynechání části snímků, na kterých se již výrazně projevilo radiační poškození. | cze |
| dc.description.abstract | Microdochium nivale from the phylum Basidiomycota is a pathogen that causes disease in turf grass. The carbohydrate oxidase from this organism has potential in industrial applications. The diffraction data of the crystallized enzyme have been measured at synchrotron Petra III. Visual inspection has revealed split reflections. The data were processed with three software packages: XDS, Xia2 and iMOSFLM (including scaling with Aimless). Radiation damage to the crystal has been observed. The optimal data processing has been done with XDS at resolution 2.0 A. Images with high influence of radiation damage have been omitted. | eng |
| dc.language.iso | CZE | |
| dc.publisher | České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum. | cze |
| dc.publisher | Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre. | eng |
| dc.rights | A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://www.cvut.cz/sites/default/files/content/d1dc93cd-5894-4521-b799-c7e715d3c59e/cs/20160901-metodicky-pokyn-c-12009-o-dodrzovani-etickych-principu-pri-priprave-vysokoskolskych.pdf | eng |
| dc.rights | Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://www.cvut.cz/sites/default/files/content/d1dc93cd-5894-4521-b799-c7e715d3c59e/cs/20160901-metodicky-pokyn-c-12009-o-dodrzovani-etickych-principu-pri-priprave-vysokoskolskych.pdf | cze |
| dc.subject | oxidáza, proteinová krystalografie, rentgenová strukturní analýza, zpracování difrakčních dat | cze |
| dc.subject | oxidase, protein crystallography, X-ray structural analysis, diffraction data processing | eng |
| dc.title | Optimalizace parametrů zpracování difrakčních dat oxidázy z Microdochium nivale | cze |
| dc.title | Optimization of processing of diffaction data of oxidase from Microdochium nivale | eng |
| dc.type | bakalářská práce | cze |
| dc.type | bachelor thesis | eng |
| dc.date.accepted | 2016-09-01 | |
| dc.contributor.referee | Švecová Leona | |
| theses.degree.discipline | Inženýrství pevných látek | cze |
| theses.degree.grantor | katedra inženýrství pevných látek | cze |
| theses.degree.programme | Aplikace přírodních věd | cze |