Prohlížení Diplomové práce - 13136 dle autora "Pospíšek Martin"
-
Efektivní výpočet podobnosti sekundárních struktur RNA
Autor: Marek Hrvol; Vedoucí práce: Kléma Jiří; Oponent práce: Pospíšek Martin
(České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2019-06-13)Tato práce se zaobírá porovnáváním sekundárních struktur RNA pomocí mělkých neuronových sítí. Název nově vytvořené metody je Struc2Vec. Způsob výpočtu je založen na přepisu sekundárních struktur na slova, která jsou následně ... -
Hledání sekundarních struktur v primarních strukturách nukleových kyselin
Autor: Anh Vu Le; Vedoucí práce: Kléma Jiří; Oponent práce: Pospíšek Martin
(České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2019-06-13)Struktura RNA molekul je významná z hlediska jejich funkce a regulace. Na objev konkrétní funkční struktury v genomu pak může být nahlíženo jako na objev funkce s ní spojené. Translace nezávislá na 5' čepičky je jednou z ... -
Hledání sekvenčních motivů v mRNA selektovaných vazbou na translační iniciační faktory z rodiny eIF4E
Autor: Jan Holčák; Vedoucí práce: Pospíšek Martin; Oponent práce: Kléma Jiří
(České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2020-09-01)Výběr vhodného nástroje hledajícího neobjevené motivy v RNA sekvencích je obtížný. Náročná instalace programů může vést k problémům s nasazením. Dostupné sady nástrojů nejsou připraveny na hromadné výpočty. Nástroje schopné ... -
Vysvětlitelné a přenositelné modely intronů hub
Autor: Barbora Mašková; Vedoucí práce: Kléma Jiří; Oponent práce: Pospíšek Martin
(České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2024-01-24)Cílem této práce je analyzovat implementovanou rekurentní konvoluční neuronovou síť navrženou pro detekci intronů v metagenomech hub a poskytnout vysvětlení za pomoci sekvenčních log. Hlavním cílem je najít minimální počet ...