Analysis of microscopy images
Analýza mikroskopických obrázků
Authors
Supervisors
Reviewers
Editors
Other contributors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
České vysoké učení technické v Praze
Czech Technical University in Prague
Czech Technical University in Prague
Date of defense
Files
Abstract
Analýza mikroskopických snímků je jedním z klíčových nástrojů biologů při pozorování genových expresí v průběhu raných stádií životního cyklu mouchy octomilky (Drosophila melanogaster), v počáteční fázi (vajíčka) a později v larvální fázi (zkoumány jsou části zvané imaginální disky).
This work aims at providing a fully automated processing and analysis pipeline for microscope images of Drosophila melanogaster (fruit fly), which is a highly valuable study subject for biologists because of high gene similarity with mammals and short life cycle.
This work aims at providing a fully automated processing and analysis pipeline for microscope images of Drosophila melanogaster (fruit fly), which is a highly valuable study subject for biologists because of high gene similarity with mammals and short life cycle.
Description
Keywords
Superpixely,segmentace obrazu,učení s učitelem,středy objektů,elipsa,růst oblasti,paprsky,histogram tříd,shlukování,tvarování,extrakce vzorů,atlas,rozklad,Graph Cut,mikroskopické obrázky,octomilka,vajíčka,imaginální disk,umístění genů, Superpixels,semantic image segmentation,instance image segmentation,(un)supervised learning,object center,ellipse fitting,region growing,ray features,label histogram,clustering,shape prior,pattern extraction,atlas,decomposition,Graph Cut,microscopy imaging,Drosophila,ovary,egg chamber,imaginal disc,gene locations
Citation
Underlying research data set URL
Permanent link
Rights/License
A university thesis is a work protected by the Copyright Act of the Czech Republic. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one`s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act.
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem v platném znění.
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem v platném znění.