ČVUT DSpace
  • Prohledat DSpace
  • English
  • Přihlásit se
  • English
  • English
Zobrazit záznam 
  •   ČVUT DSpace
  • České vysoké učení technické v Praze
  • Fakulta elektrotechnická
  • katedra kybernetiky
  • Bakalářské práce - 13133
  • Zobrazit záznam
  • České vysoké učení technické v Praze
  • Fakulta elektrotechnická
  • katedra kybernetiky
  • Bakalářské práce - 13133
  • Zobrazit záznam
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Hledání cest v proteinových strukturách

Path Planning in Protein Structures

Typ dokumentu
bakalářská práce
bachelor thesis
Autor
Jankovec Tom
Vedoucí práce
Vonásek Vojtěch
Oponent práce
Kozlíková Barbora
Studijní obor
Robotika
Studijní program
Kybernetika a robotika
Instituce přidělující hodnost
katedra kybernetiky



Práva
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://www.cvut.cz/sites/default/files/content/d1dc93cd-5894-4521-b799-c7e715d3c59e/cs/20160901-metodicky-pokyn-c-12009-o-dodrzovani-etickych-principu-pri-priprave-vysokoskolskych.pdf
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://www.cvut.cz/sites/default/files/content/d1dc93cd-5894-4521-b799-c7e715d3c59e/cs/20160901-metodicky-pokyn-c-12009-o-dodrzovani-etickych-principu-pri-priprave-vysokoskolskych.pdf
Metadata
Zobrazit celý záznam
Abstrakt
Problematika detekce dutin a tunelů v proteinových molekulových strukturách je intenzivně zkoumaným tématem jak z biochemického tak z informatického hlediska, s širokým spektrem aplikací, kterými jsou například návrh léků či proteinové inženýrství. Existuje řada softwarových nástrojů (příkladem je fpocket a CAVER), které umožňují detekci a analýzů proteinových tunelů. Cílem této bakalářské práce je vytvoření nové alternativní metody pro detekci proteinových tunelů, za využití algoritmů pocházejících z oblasti robotiky (například algoritmu Rapidly-exploring Random Trees). Nově navržená metoda využívá konceptu zakázaných oblastí pro ovlivnění způsobu růstu stromu, spolu s řadou dalších modifikací, které umožňují najít proteinové tunely v molekulách.
 
The problem of protein cavity and tunnel detection in is a widely studied topic both from the biochemical and the computational standpoint, with a broad spectrum of applications, such as pharmaceutical design and protein engineering. A number of software tools currently exists, such as the fpocket and CAVER, which allow for protein tunnel detection and analysis. The goal of this thesis is to propose a new alternative method for protein tunnel detection, which utilizes well established and analyzed algorithms originating in the field of robotics, namely the Rapidly-exploring Random Trees algorithm. The novel method utilizes a novel concept of disabled areas to guide the tree growth, plus a score of other modifications to allow the algorithm to find multiple protein tunnels.
 
URI
http://hdl.handle.net/10467/64656
Zobrazit/otevřít
PLNY_TEXT (44.81Mb)
PRILOHA (555.7Kb)
PRILOHA (5.442Mb)
PRILOHA (18.00Mb)
PRILOHA (36.67Mb)
POSUDEK (125.5Kb)
POSUDEK (50.98Kb)
Kolekce
  • Bakalářské práce - 13133 [851]

České vysoké učení technické v Praze copyright © 2016 

DSpace software copyright © 2002-2016  Duraspace

Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
@mire NV
 

 

Užitečné odkazy

ČVUT v PrazeÚstřední knihovna ČVUTO digitální knihovně ČVUTInformační zdrojePodpora studiaPodpora publikování

Procházet

Vše v DSpaceKomunity a kolekceDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slovaTato kolekceDle data publikováníAutořiNázvyKlíčová slova

Můj účet

Přihlásit se

České vysoké učení technické v Praze copyright © 2016 

DSpace software copyright © 2002-2016  Duraspace

Kontaktujte nás | Vyjádření názoru
Theme by 
@mire NV