Motor evoked potentials acquisition and analysis in dystonic syndromes
Měření a analýza motorických evokovaných potenciálů u dystonických syndromů
Authors
Supervisors
Reviewers
Editors
Other contributors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
České vysoké učení technické v Praze
Czech Technical University in Prague
Czech Technical University in Prague
Date of defense
2023-06-20
Abstract
Hluboká mozková stimulace (DBS) vnitřního pallida se u farmakorezistentních dystonických syndromů stala rutinní léčebnou metodou. Cílem disertační práce je přispět k identifikaci elektrofyziologických biomarkerů, které pomohou odlišit dystonické pacienty profitující z terapie DBS od pacientů, kterým tato metoda nepřináší žádné zlepšení. Práce se věnuje návrhu a realizaci HW a SW prostředků pro elektrofyziologické vyšetření pomocí transkraniální magnetické stimulace (TMS) a zpracování naměřených dat. Celkem bylo v navrženém protokolu vyšetřeno 22 pacientů (věk 51 ± 17 let) ve stavu zapnuté a vypnuté DBS a 22 párovaných kontrolních subjektů. V rámci sezení byla hodnocena tíže onemocnění pomocí klinických škál (BFMDS, TWSTR, UMDS) a měřena krátkolatentní intrakortikální inhibice (SICI). Data byla zpracována jak manuálně pomocí SW vytvořeného v jazyce Signal (Cambridge Electronics Design), tak i pomocí automatických algoritmů v MATLABu. Na základě statistického zpracování byly prokázány signifikantní rozdíly v hodnotách biomarkerů (latence evokovaných potenciálů, inhibiční poměr) mezi skupinou pacientů odpovídajících a neodpovídajících na DBS terapii. V závěru práce obsahuje návrh klasifikace pacientů pomocí metod strojového učení (rozhodovací strom, k-NN klasifikátor, Bayesovský klasifikátor) jako možný nástroj pro predikci efektu DBS terapie v klinické praxi.
Deep brain stimulation (DBS) of the internal pallidum has become a routine treatment method for pharmacoresistant dystonic syndromes. The aim of the dissertation is to contribute to the identification of electrophysiological biomarkers that will help distinguish dystonic patients benefiting from DBS therapy from patients for whom this method does not bring any improvement. The work is devoted to the design and implementation of hardware and software for electrophysiological examination using transcranial magnetic stimulation (TMS) and processing of measured data. In total, 22 patients (age 51 ± 17 years) in the on and off DBS condition and 22 matched control subjects were examined in the proposed protocol. Within the session, disease severity was assessed using clinical scales (BFMDS, TWSTR, UMDS) and short-latency intracortical inhibition (SICI) was measured. The data were processed manually using custom-written scripts in the Signal language (Cambridge Electronics Design) as well as using automatic algorithms in MATLAB. Based on statistical processing, significant differences in biomarker values (latency of evoked potentials, inhibition ratio) were demonstrated between the group of patients responding and not responding to DBS therapy. At the end of the work, a proposal for classifying patients using machine learning methods (decision tree, k- NN classifier, Bayesian classifier) as a possible tool for predicting the effect of DBS therapy in clinical practice.
Deep brain stimulation (DBS) of the internal pallidum has become a routine treatment method for pharmacoresistant dystonic syndromes. The aim of the dissertation is to contribute to the identification of electrophysiological biomarkers that will help distinguish dystonic patients benefiting from DBS therapy from patients for whom this method does not bring any improvement. The work is devoted to the design and implementation of hardware and software for electrophysiological examination using transcranial magnetic stimulation (TMS) and processing of measured data. In total, 22 patients (age 51 ± 17 years) in the on and off DBS condition and 22 matched control subjects were examined in the proposed protocol. Within the session, disease severity was assessed using clinical scales (BFMDS, TWSTR, UMDS) and short-latency intracortical inhibition (SICI) was measured. The data were processed manually using custom-written scripts in the Signal language (Cambridge Electronics Design) as well as using automatic algorithms in MATLAB. Based on statistical processing, significant differences in biomarker values (latency of evoked potentials, inhibition ratio) were demonstrated between the group of patients responding and not responding to DBS therapy. At the end of the work, a proposal for classifying patients using machine learning methods (decision tree, k- NN classifier, Bayesian classifier) as a possible tool for predicting the effect of DBS therapy in clinical practice.
Description
Keywords
Hluboká mozková stimulace, dystonie, transkraniální magnetická stimulace, motorickýevokovaný potenciál, intrakortikální inhibice (SICI), akvizice signálu, zpracování signálu, DBSbiomarker, programovací jazyk Signal (CED), MATLAB, strojové učení, Deep brain stimulation, dystonia, transcranial magnetic stimulation, motor evoked potential, short interval intracortical inhibition (SICI), signal acquisition, signal processing, DBS biomarker, Signal programming language (CED), MATLAB, machine learning
Citation
Underlying research data set URL
Permanent link
Rights/License
A university thesis is a work protected by the Copyright Act of the Czech Republic. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one`s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act.
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem v platném znění.
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem v platném znění.