ČVUT DSpace
  • Search DSpace
  • Čeština
  • Login
  • Čeština
  • Čeština
View Item 
  •   ČVUT DSpace
  • Czech Technical University in Prague
  • Faculty of Electrical Engineering
  • Department of Cybernetics
  • Bachelor Theses - 13133
  • View Item
  • Czech Technical University in Prague
  • Faculty of Electrical Engineering
  • Department of Cybernetics
  • Bachelor Theses - 13133
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Automatická predikce funkce bílkovin jako hierarchická multi-label klasifikace

Hierarchical Multi-Label Classification for Automated Protein Function Prediction

Type of document
bakalářská práce
bachelor thesis
Author
Martin Miadok
Supervisor
Kléma Jiří
Opponent
Pošík Petr
Field of study
Základy umělé inteligence a počítačových věd
Study program
Otevřená informatika
Institutions assigning rank
katedra kybernetiky



Rights
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Vysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Metadata
Show full item record
Abstract
Priradzovaniu funkcie bielkovinám môže predchádzať predpovedanie ich funkcie pomocou automatických klasifikátorov. Táto práca sa venuje hierarchickej nadstavbe algoritmu BLAST-KNN, ktorý priradzuje bielkovinám atribúty z génovej ontológie na základe sekvencie aminokyselín. Nadstavba spočíva v ohodnotení hierarchických predkov atribútov a následnej klasifikácii pomocou modifikovaného algoritmu TPR. Anotácie sú vyhodnotené na ontológiách biologických procesov a molekulárnych funkcií pomocou precíznosti a senzitivity voči reálnym anotáciam.
 
Protein function prediction using automatic classifiers may precede the actual function assignment. This thesis describes the hierarchical extension of the BLAST-KNN algorithm, which assigns gene ontology terms to proteins based on the amino acid sequences. The extension consists of the annotation of hierarchical ancestors of the terms and subsequent classification using a modified TPR algorithm. The results of the annotation by the terms from the biological process and molecular function ontologies are compared through precision and recall with the real annotations.
 
URI
http://hdl.handle.net/10467/101255
View/Open
PLNY_TEXT (549.2Kb)
PRILOHA (25.98Mb)
POSUDEK (484.0Kb)
POSUDEK (234.9Kb)
Collections
  • Bakalářské práce - 13133 [851]

České vysoké učení technické v Praze copyright © 2016 

DSpace software copyright © 2002-2016  Duraspace

Contact Us | Send Feedback
Theme by 
@mire NV
 

 

Useful links

CTU in PragueCentral library of CTUAbout CTU Digital LibraryResourcesStudy and library skillsResearch support

Browse

All of DSpaceCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

My Account

Login

České vysoké učení technické v Praze copyright © 2016 

DSpace software copyright © 2002-2016  Duraspace

Contact Us | Send Feedback
Theme by 
@mire NV