MassSpecBlocks: Databáze sekvencí a stavebních bloků mikrobiálních metabolitů pro analýzu hmotnostních spekter
MassSpecBlocks: Database of Sequences and Building Blocks of Microbial Metabolites for Mass Spectra Analysis
Type of document
diplomová prácemaster thesis
Author
Jan Přívratský
Supervisor
Novák Jiří
Opponent
Suchánek Marek
Field of study
Webové a softwarové inženýrstvíStudy program
Informatika 2010Institutions assigning rank
katedra softwarového inženýrstvíRights
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.htmlVysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Metadata
Show full item recordAbstract
Pro potřeby charakterizace neribozomálních peptidů z hmotnostních spekter vznikla nová aplikace MassSpecBlocks - webová open-source aplikace vycházející z aplikace "Building Blocks Database Generator of Natural Compounds" (Bbdgnc) s možností vyhledávání chemických struktur ve veřejných databázích jako PubChem, ChemSpider, ChEBI a Norine. Struktury se mohou rozpadat na bloky v místech peptidových a esterových vazeb s možností editace. MassSpecBlocks může fungovat jako samostatná databáze, kam si mohou uživatelé přidávat a kde mohou spravovat své vlastní struktury, pro jejich potřeby například v hmotnostní spektrometrii. A new open-source and web-based application MassSpecBlocks has been developed to characterize nonribosomal peptides from mass spectra. The application is based on the "Building Blocks Database Generator of Natural Compounds" (Bbdgnc) and can search chemical structures in public databases like PubChem, ChemSpider, ChEBI, and Norine. Structures can be crumbled into blocks in places like peptide or ester bonds, with the possibility to edit these places. MassSpecBlocks can work as a standalone database, where users can add and manage their structures for mass spectrometry experiments or other purposes
Collections
- Diplomové práce - 18102 [1005]
Related items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Modernizace obvodového pláště panelového objektu Novodvorská 1081/92 s využitím předsazené lodžie
Author: Smolík Jan; Supervisor: Fiala Ctislav; Opponent: Handlíř Miroslav
(České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2018-06-26)V předložené práci studuji vady panelových domů z architektonického, konstrukčního a energetického hlediska a hledám jak tyto vady odstranit. Výsledkem je projektová dokumentace k modernizaci sekce panelového domu typu T ... -
DOTVOŘENÍ SEVERNÍHO NÁBŘEŽÍ HOLEŠOVIC
Author: Eva Trnková; Supervisor: Sedlák Jan; Opponent: Gavlas Michal
(České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2020-01-31)Práce se zabývá řešením transformačního území MČ Praha 7 v severní části holešovického meandru, resp. jeho část přiléhající k levému břehu Vltavy vymezená ulicí U Pergamenky. V úvodní části práce je popsán a stanoven ... -
Zkvalitnění železničního provozu v úseku Děčín hl. n. - Benešov nad Ploučnicí
Author: Černá Renata; Supervisor: Drábek Michal; Opponent: Jacura Martin
(České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2015-11-30)Práce se zabývá jednokolejným úsekem Děčín hl. n. - Benešov nad Ploučnicí, který lze z provozního hlediska považovat za omezující. Plánovaný provozní koncept požadovaný objednateli veřejné osobní dopravy není možný z důvodu ...