Zpracování MRI snímků v kardiologii (MRI tagging) pomocí metod využívajících Fourierovu transformaci

Abstract

Ve své bakalářské práci se zabývám zpracováním kardiovaskulárních snímků z magnetické rezonance s přídavným gradientem, takzvaným MRI tagging. Práce je součástí studie Kardiologické kliniky 2. LF UK a FN Motol, která se zabývá léčbou srdeční dyssynchronie. Ta se projevuje nerovnoměrnou aktivitou částí levé komory. Cílem je tvorba programu, který by byl nápomocný v rozhodovacím procesu, zdali je pacient vhodným kandidátem pro podstoupení srdeční resynchronizační terapie, CRT. Program v MatLabu je schopen načíst data ve formátu DICOM. Je schopen zároveň pracovat s transversálními i longitudinálními snímky. Pomocí Fourierovy transformace program dokáže zrekonstruovat pohyblivou mřížku a na základě její analýzy může exportovat pohybový vektor, počítat příčnou deformaci, tzv. radial strain a zároveň torzní deformaci, tj. circumferential strain. Vypočítaná data jsou reprezentována v podobě grafů mechanické deformace levé komory, ze kterých lze odečíst rozdíly v deformaci segmentů levé komory a tak diagnostikovat poruchu převodního systému srdečního. Bylo zjištěno, že pro tuto metodu nejsou vhodné longitudinální řezy.

Bachelor's thesis deals with the processing of cardiovascular images from magnetic resonance with an additional gradient, so-called MRI tagging. Thesis is part of project currently running at Cardiology Clinic of the 2nd Faculty of Medicine of the Charles University and Motol University Hospital, which deals with the treatment of cardiac dyssynchrony. This is manifested by the uneven activity of parts of the left ventricle. The aim is to create a program that would assist in the decision making process whether the patient is a suitable candidate for cardiac resynchronization therapy, CRT. The MatLab program is able to load data in DICOM format. It is also capable of working with both transversal and longitudinal sequences. Using the Fourier Transform, the program can reconstruct the movable. Based on its analysis, it can export the motion vector, compute the transversal deformation, the so-called radial strain, and the circumferential strain. The calculated data are represented in the graphs of left ventricular mechanical deformation from which the differences in deformation of the left ventricular segments it is possible to diagnose cardiac transduction system disorder. In conclusion, this method is not suitable for longitudinal sections computation.