Modelování toku auxinů buňkou
Modeling of Auxin Flux through Cell
Type of document
bakalářská prácebachelor thesis
Author
Hošek Petr
Supervisor
Jiřina Marcel
Opponent
Friml Jiří
Field of study
Biomedicínská a klinická technikaStudy program
Biomedicínská a klinická technikaInstitutions assigning rank
katedra biomedicínské technikyDefended
2008-06-24Rights
A university thesis is a work protected by the Copyright Act. Extracts, copies and transcripts of the thesis are allowed for personal use only and at one?s own expense. The use of thesis should be in compliance with the Copyright Act http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf and the citation ethics http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.htmlVysokoškolská závěrečná práce je dílo chráněné autorským zákonem. Je možné pořizovat z něj na své náklady a pro svoji osobní potřebu výpisy, opisy a rozmnoženiny. Jeho využití musí být v souladu s autorským zákonem http://www.mkcr.cz/assets/autorske-pravo/01-3982006.pdf a citační etikou http://knihovny.cvut.cz/vychova/vskp.html
Metadata
Show full item recordAbstract
Modely založené na dosavadních znalostech mechanismů odpovědných za tok auxinu buňkou nejsou dokonale přesné. Jedním z jejich nedostatků je, že dílčí poznatky jsou často učiněny jen na základě porovnání výsledků simulací na úrovni pletiva s reálnými vzory pozorovanými u vyšších rostlin. Protože transport auxinu na úrovni pletiva je d ěj značněkomplikovaný, může být výhodné použít data produkovaná na úrovni jednotlivých buněk pro tvorbu detailního modelu toku auxinu buňkou. V úvodu této práce jsou stručně vysvětleny nejběžnější mechanismy transportu auxinu. Následující část popisuje některé existující modely v kontextu jejich možné modifikace tak, aby byly schopné vyhovět dostupným datům. Další kapitola je věnována odvození modelu difúzního toku auxinu. V části závěrečné je pak zmíněna implementace modelu v prostředí Matlab, jeho verifikace pomocí dat naměřených na úrovni jednotlivých buněk a dosažené výsledky jsou diskutovány. Models based on contemporary knowledge of the mechanisms responsible for auxin flux through cell are not perfectly precise. One of their basic weaknesses is that particular findings are often made just by comparing an outcome of tissue-level simulations with real flux patterns observed in higher plants. With the tissue-level auxin transport being such a complex process, advantage could be taken of using a single cell data to create a detailed model of auxin flux through cell. In the beginning of the thesis a brief explanation of the most common auxin transport mechanisms will be given. In the following section several existing models are to be described in the context of their possible modification to suit available data. Then a model of auxin diffusion will be derived. Lastly, the implementation of the model in Matlab and its verification using single cell data will be mentioned and discussed.
Collections
- Bakalářské práce - 17110 [869]