Software pro vizualizaci, segmentaci a sonifikaci ultrazvukových vokalizací laboratorních potkanů

Abstract

Tato práce představuje Squeak Peek Studio, uživatelsky přívětivou MATLAB aplikaci pro analýzu ultrazvukových vokalizací (USV) laboratorních potkanů. Software je navržen pro intuitivní použití a integraci do stávajících výzkumných pracovních postupů. Kombinuje segmentaci, vizualizaci, sonifikaci a vyhodnocení v jednotném rozhraní. Implementuje několik detekčních algoritmů - včetně prahovacích a bayesovských metod - s laditelnými parametry a možností interaktivní úpravy. Modul sonifikace založený na fázovém vokodéru a synchronizace videa umožňuje hlubší interpretaci chování. Cílem nástroje je zefektivnit analýzu USV a podpořit jak automatizované tak i manuální zpracování.

This thesis presents Squeak Peek Studio, a user-friendly MATLAB application for analyzing ultrasonic vocalizations (USVs) in laboratory rats. Designed for intuitive use and integration into existing research workflows, the software combines segmentation, visualization, sonification, and evaluation in a unified interface. It implements multiple detection algorithms - including threshold-based and Bayesian methods - with tunable parameters and interactive editing. A phase vocoder-based sonification module and video synchronization enable deeper behavioral interpretation. The tool aims to streamline USV analysis and support both automated processing and human-in-the-loop refinement.