Evaluace rozlišení v lokalizační superrozlišovací mikroskopii

Abstract

Diplomová práce se zabývá algoritmickým vyhodnocením snímků DNA origami pomocí super-rozlišovací lokalizační mikroskopie (Single-molecule Localization Microscopy, SMLM) metodou DNA-PAINT (Point Accumulation In Nanoscale Topography). Pro hodnocení super-rozlišených dat byla použita metoda FRC (Fourier Ring Correlation). Část práce je věnována seznámení s principem metody RESI (Resolution Enhancement by Sequential Imaging), která umožňuje získání lepšího rozlišení, než je super-rozlišení. Toto rozlišení můžeme nazvat jako ultra-rozlišení. V rámci experimentální části práce jsou vyhodnoceny snímky nasyntetizovaných DNA origami pomocí SMLM a RESI. Je určeno rozlišení těchto super-rozlišených a ultra-rozlišených dat, které je následně hodnoceno. V rámci práce je navržena nová metoda pro vizualizaci ultra-rozlišených dat s ohledem na super-rozlišená data.The thesis deals with the algorithmic evaluation of DNA origami images by super-resolution localization microscopy (Single-Molecule Localization Microscopy, SMLM) using the DNA-PAINT (Point Accumulation In Nanoscale Topography) method. For the evaluation of super-resolution images was used the FRC (Fourier Ring Correlation) method. Part of the work is devoted to the introduction of the principle of the RESI (Resolution Enhancement by Sequential Imaging) method, which allows obtaining better resolution than super-resolution. This resolution can be called as ultra-resolution. In the experimental part of the work, the images of synthesized DNA origami are evaluated by SMLM and RESI. The resolution of these super-resolved and ultra-resolved data is determined and then evaluated. A new method is proposed for visualizing the ultra-resolved data with respect to the super-resolved data.