• Aplikace konečných smíšených modelů pro analýzu genetické informace z DNA 

      Autor: Pilný Vladimír; Vedoucí práce: Tkacz Ewaryst; Oponent práce: Jiřina Marcel
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2006-06-09)
      Tato práce se týká analýzy dat genové exprese měřených pomocí DNAčipů. Prvníčástpředstavuje biologickýúvod do celé problematiky, počínaje přípravou genetických vzorkůaž po převod nasnímaných dat na hodnoty genové exprese. ...
    • Assessing Exhaust Toxicity with Biological Detector: Configuration of Portable Air-Liquid Interface Human Lung Cell Model Exposure System, Sampling Train and Test Conditions 

      Autor: Vojtíšek M.; Pechout M.; Macoun D.; Rameswaran R.; Praharaj K.; Červená T.; Topinka J.; Rossner P.
      (SAE International, 2019)
      Air pollution remains to be one of the leading causes of premature death worldwide, with significant share attributed to particulate matter and reactive nitrogen compounds from mobile sources. Due to discrepancies between ...
    • Automatická detekce intronů v genomech hub pomocí pravděpodobnostních modelů 

      Autor: Marek Zvara; Vedoucí práce: Kléma Jiří; Oponent práce: Větrovský Tomáš
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2019-06-18)
      Huby sú rozmanité spoločenstvo a pri veľa druhoch doposiaľ nepoznáme ich genóm a funkcie ich génov. Detekcia intrónových oblastí môže pomôcť k vzájomnému celogenómovému porovnaniu húb a určenie ich vzájomných príbuzností. ...
    • Bioinformatická analýza RNA-seq dat 

      Autor: Irma Snášelová; Vedoucí práce: Dvorský Bohuslav; Oponent práce: Klempíř Ondřej
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2022-06-14)
      Bakalářská práce se věnuje analýze sekvenačních dat se zvláštním zaměřením na sekvenování nové generace (next-generation sequencing), kam se rovněž řadí RNA-seq, během kterého dochází k sekvenování celého transkriptomu. ...
    • Breaking DNA strands by extreme-ultraviolet laser pulses in vacuum 

      Autor: Nováková E.; Vyšín L.; Burian T.; Juha L.; Davídková M.; Múčka V.; Čuba V.; Grisham M. E.; Heinbuch S.; Rocca J. J.
      (American Physical Society, 2015)
      Ionizing radiation induces a variety of DNA damages including single-strand breaks (SSBs), double-strand breaks (DSBs), abasic sites, modified sugars, and bases. Most theoretical and experimental studies have been focused ...
    • Detekce selekčních tlaků na lidské endogenní retroviry 

      Autor: Tuan Anh Ho; Vedoucí práce: Pačes Jan; Oponent práce: Le Anh Vu
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2020-06-09)
      Lidský genom se skládá z kódující a nekódující DNA. Kódující DNA obsahuje asi dvě procenta genomu. Kóduje proteiny, molekuly funkční RNA a regulační prvky. Podstatná část nekódující DNA se také v různé míře přepisuje na ...
    • Tvorba podrobných dynamických modelů struktury DNA plasmidu 

      Autor: Klára Stefanová; Vedoucí práce: Štěpán Václav; Oponent práce: Davídková Marie
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2019-09-05)
      Plasmidy, uzavřené kruhové smyčky DNA, lze nalézt v~cytoplasmě bakterií. Často jsou v radiobiologických experimentech využívány jako zjednodušený model buněčné DNA. Teoretické část popisuje možnosti použití plasmidu jako ...
    • Vliv parametrů prostředí na poškození plasmidu DNA ionizujícím zářením 

      Autor: Klára Stefanová; Vedoucí práce: Štěpán Václav; Oponent práce: Šefl Martin
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2021-09-10)
      Plasmidy jsou v radiobiologii využívány mimo jiné i jako přiblížení pro DNA v jádře buňky. Přitom jsou ale běžně uchovávány a ozařovány v podmínkách, které se od těch v buňce značně liší. Pokud by to mělo vliv i na výtěžky ...
    • Webová aplikace pro detekci somatických bodových variant u pacientů s leukémii 

      Autor: Matěj Koudelka; Vedoucí práce: Klempíř Ondřej; Oponent práce: Přistoupilová Anna
      (České vysoké učení technické v Praze. Vypočetní a informační centrum.Czech Technical University in Prague. Computing and Information Centre., 2023-06-21)
      Diplomová práce zkoumá RNA sekvence izolovaných leukocytů u pacientů s leukémií v genu kinázové domény fúzního genu BCR::ABL1. Zkoumá hlavně chronickou myeloidní leukémii a PH pozitivní akutní lymfoblastickou leukémii ...